Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Hoxd13P70217 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd13P70217 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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