Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Zfp207-208ENSMUST00000188489 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2056J3QQ02 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2056J3QQ02 Smco3-203ENSMUST00000203468 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2056J3QQ02 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2056J3QQ02 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2056J3QQ02 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2056J3QQ02 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2056J3QQ02 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2056J3QQ02 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2056J3QQ02 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2056J3QQ02 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2056J3QQ02 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2056J3QQ02 Gm17076-201ENSMUST00000165185 1401 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2056J3QQ02 Gm9866-203ENSMUST00000182592 8487 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2056J3QQ02 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Proz-201ENSMUST00000033822 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm30504-203ENSMUST00000209762 1048 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Peak1-201ENSMUST00000061552 6996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 4921509C19Rik-201ENSMUST00000080132 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm42519-201ENSMUST00000199282 3656 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm11870-201ENSMUST00000119255 1322 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Musk-207ENSMUST00000177951 3352 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Musk-204ENSMUST00000098059 3352 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Map3k7-203ENSMUST00000108183 5416 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Ndst2-205ENSMUST00000225000 3661 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Dennd6a-205ENSMUST00000224378 2424 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm4919-201ENSMUST00000117825 604 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm12987-201ENSMUST00000118562 489 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2056J3QQ02 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms