Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Elmo2-205ENSMUST00000103091 4695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gdpgp1-201ENSMUST00000062915 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Fbxw7-202ENSMUST00000107675 3599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Scn2a-205ENSMUST00000200829 6348 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Luzp2-201ENSMUST00000082373 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Dicer1-201ENSMUST00000041987 9851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm43679-201ENSMUST00000197051 3677 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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Col5a3Q9JLI2 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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Col5a3Q9JLI2 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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Col5a3Q9JLI2 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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Col5a3Q9JLI2 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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