Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp29Q9ES63 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp29Q9ES63 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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