Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Lrrc8d-202ENSMUST00000120847 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Rbm43-206ENSMUST00000165313 1975 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Zfp58-201ENSMUST00000076123 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Xaf1-204ENSMUST00000146233 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Xdh-201ENSMUST00000024866 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Tbce-201ENSMUST00000039894 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Hdac7-206ENSMUST00000119670 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Homer1-204ENSMUST00000102752 5713 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Adgrg7-201ENSMUST00000023437 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Sema6a-203ENSMUST00000115449 6815 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Tusc5-201ENSMUST00000062024 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm12258-201ENSMUST00000093768 2524 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Olfr531-201ENSMUST00000080153 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Tcp10b-201ENSMUST00000086787 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm7534-201ENSMUST00000097849 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Cald1-203ENSMUST00000115021 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Recql5os1-201ENSMUST00000134391 396 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm26356-201ENSMUST00000158217 283 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm9169-201ENSMUST00000182930 536 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm45705-201ENSMUST00000211831 2134 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Sh2d6-201ENSMUST00000089687 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Zic4-201ENSMUST00000066384 3891 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Ccnc-201ENSMUST00000065928 3484 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Pcdhga2-201ENSMUST00000193869 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Lpin1-205ENSMUST00000221297 3100 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Limk2-204ENSMUST00000110029 2939 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm31983-202ENSMUST00000210553 3155 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Rnf41-202ENSMUST00000171342 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Fam149b-210ENSMUST00000224721 4483 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 0610031O16Rik-203ENSMUST00000185046 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Abca17-201ENSMUST00000039324 5202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Krt39-201ENSMUST00000076948 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 1700017G19Rik-201ENSMUST00000035860 2437 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Mep1a-201ENSMUST00000024707 2921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Dab2-202ENSMUST00000080880 4663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Clca2-201ENSMUST00000040465 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Nrp2-201ENSMUST00000027112 4216 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm10302-201ENSMUST00000174433 3535 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Mpp2-201ENSMUST00000017458 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm13573-201ENSMUST00000116410 631 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms