Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm37150-201ENSMUST00000193900 2754 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Ccnb1-202ENSMUST00000091295 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Txnip-202ENSMUST00000074519 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Etl4-206ENSMUST00000114608 6635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Ttc30a1-201ENSMUST00000099994 3721 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Frrs1-201ENSMUST00000040260 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Pla2g4d-201ENSMUST00000094665 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Mapk6-202ENSMUST00000168937 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Scn11a-202ENSMUST00000215718 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 4930543E12Rik-202ENSMUST00000210408 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Grip1-210ENSMUST00000144825 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm43917-201ENSMUST00000191984 2360 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm43609-201ENSMUST00000199084 2712 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Tecta-201ENSMUST00000042190 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Rapgef6-210ENSMUST00000207429 5164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Ocln-202ENSMUST00000069756 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Tubgcp5-201ENSMUST00000032627 3905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 C87436-202ENSMUST00000113698 2922 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Zzz3-203ENSMUST00000106101 7539 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Smg9Q9DB90 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms