Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Ighv2-4-201ENSMUST00000103447 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Rpl9-ps2-201ENSMUST00000120821 577 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm16150-201ENSMUST00000127620 437 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm11827-201ENSMUST00000142297 1257 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Apela-202ENSMUST00000142822 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm14437-201ENSMUST00000152284 360 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm43647-201ENSMUST00000198142 486 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 A930040O22Rik-201ENSMUST00000221662 973 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Plac8-201ENSMUST00000031264 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 9530052C20Rik-201ENSMUST00000181882 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm22900-201ENSMUST00000104538 130 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm12121-201ENSMUST00000131630 500 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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