Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Use1Q9CQ56 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Use1Q9CQ56 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms