Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Tenm4-201ENSMUST00000107162 11021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm33037-201ENSMUST00000217927 642 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Olfr523-205ENSMUST00000215785 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Plxna4-201ENSMUST00000115096 12877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Ccdc18Q640L5 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Ccdc18Q640L5 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ccdc18Q640L5 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ccdc18Q640L5 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc18Q640L5 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Ccdc18Q640L5 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Ccdc18Q640L5 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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