Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SmsP97355 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SmsP97355 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.1 ms