Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms