Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Rin3-204ENSMUST00000133820 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Tnni3k-201ENSMUST00000064076 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Retreg1-203ENSMUST00000226438 2783 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Trpv1-202ENSMUST00000102526 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Kcnma1-203ENSMUST00000100831 3261 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Pcdh15-236ENSMUST00000193174 5936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Abce1-201ENSMUST00000080536 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gulp1-201ENSMUST00000074525 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm7831-201ENSMUST00000117990 552 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Prg4Q9JM99 Gm6799-201ENSMUST00000186919 573 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Prg4Q9JM99 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Prg4Q9JM99 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Rpsa-ps2-201ENSMUST00000059546 880 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Itgam-205ENSMUST00000120355 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Synpo2-201ENSMUST00000051443 3719 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Ttc41-203ENSMUST00000217747 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Vezt-203ENSMUST00000118205 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Zfp474-202ENSMUST00000209270 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Gm6284-201ENSMUST00000209609 4287 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Zkscan8-201ENSMUST00000045228 8805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Prg4Q9JM99 Mas1-206ENSMUST00000162333 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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