Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Prpf40a-208ENSMUST00000210789 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Kalrn-212ENSMUST00000114973 5253 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Itgb6-201ENSMUST00000028348 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Sf3a3-201ENSMUST00000030734 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Cyp2c50-202ENSMUST00000080171 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Mettl8-204ENSMUST00000112186 2347 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Thbs1-201ENSMUST00000039559 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Gpr85-202ENSMUST00000115491 2165 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Gm29302-201ENSMUST00000187209 2167 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Rbm19-201ENSMUST00000031590 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Pcdhb5-201ENSMUST00000078271 3535 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Snx25-201ENSMUST00000041582 3206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Gm45861-201ENSMUST00000209669 7184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Fgd3-202ENSMUST00000110086 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Jam2-202ENSMUST00000114195 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 AL662807.2-201ENSMUST00000224024 3335 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Riok3Q9DBU3 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 4933430I17Rik-201ENSMUST00000062145 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Prc1-201ENSMUST00000047558 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm43910-201ENSMUST00000204561 3241 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Ces1a-201ENSMUST00000095211 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm13415-201ENSMUST00000131886 3089 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Myo6-203ENSMUST00000113266 7632 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Tbccd1-201ENSMUST00000004576 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm14370-201ENSMUST00000122460 868 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm16212-201ENSMUST00000136190 282 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm15273-201ENSMUST00000142302 868 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm13778-202ENSMUST00000146633 537 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm7023-201ENSMUST00000147295 868 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm14361-201ENSMUST00000178547 868 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm14348-201ENSMUST00000179183 868 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 1700029N11Rik-203ENSMUST00000220639 1092 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Srsf5-203ENSMUST00000110352 1491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Padi3-202ENSMUST00000172098 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Hsd17b7-201ENSMUST00000027989 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Rnft1-201ENSMUST00000020827 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Ces1e-201ENSMUST00000034173 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 C6-204ENSMUST00000162585 2876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Eftud2-212ENSMUST00000173679 2889 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Adam17-201ENSMUST00000064536 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Slc7a9-201ENSMUST00000032703 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Cldn34c1-202ENSMUST00000113348 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Olfr1219-203ENSMUST00000214442 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Riok3Q9DBU3 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 332.7 ms