Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gucy2c-202ENSMUST00000078095 3863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm43679-201ENSMUST00000197051 3677 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Slc5a6-201ENSMUST00000080431 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Spag9-205ENSMUST00000103168 6840 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Trerf1-205ENSMUST00000190080 7045 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Dclk1-207ENSMUST00000198412 4282 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NischQ80TM9 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms