Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Akap8-201ENSMUST00000002699 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Slc2a9-210ENSMUST00000155634 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Sdad1-203ENSMUST00000201143 2156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Rpgr-205ENSMUST00000115533 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Kcnma1-206ENSMUST00000163322 3162 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Kcnma1-210ENSMUST00000179836 3177 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm28720-201ENSMUST00000190728 3156 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm17229-202ENSMUST00000166792 1753 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Chid1-203ENSMUST00000118694 3910 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Fmr1-202ENSMUST00000114653 4058 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Mpdz-201ENSMUST00000102830 7512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Zfat-202ENSMUST00000160248 3866 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Fam168a-202ENSMUST00000107042 6388 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm37334-201ENSMUST00000192325 2938 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 AC122533.2-201ENSMUST00000223772 545 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gbp8-201ENSMUST00000031235 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Proz-201ENSMUST00000033822 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Pxmp4-201ENSMUST00000000896 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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Rpusd2Q149F1 Zfp758-204ENSMUST00000149699 2876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Pcyt1a-201ENSMUST00000079791 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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Rpusd2Q149F1 Cep41-201ENSMUST00000031810 3447 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Pofut1-206ENSMUST00000123487 4143 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Ano7-202ENSMUST00000186641 3984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Atxn7l1-213ENSMUST00000154742 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Dusp3-201ENSMUST00000003612 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Mkrn2-201ENSMUST00000000449 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Slc34a1-205ENSMUST00000225259 3983 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Cd200r4-201ENSMUST00000114626 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Nrf1-204ENSMUST00000115199 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Rbm28-201ENSMUST00000007993 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm17076-201ENSMUST00000165185 1401 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Ube2k-207ENSMUST00000202082 4506 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 6430562O15Rik-202ENSMUST00000180808 3997 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gng7-204ENSMUST00000118233 3433 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpusd2Q149F1 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms