Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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