Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rps27aP62983 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.8 ms