Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TP20293 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TP20293 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms