Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 6430503K07Rik-201ENSMUST00000144411 476 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccl20O89093 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms