Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Clcn3-205ENSMUST00000110302 3768 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm26344-201ENSMUST00000104553 132 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm14141-201ENSMUST00000120236 783 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm14911-201ENSMUST00000120803 989 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm8084-201ENSMUST00000120807 752 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm15009-201ENSMUST00000121387 322 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm26719-201ENSMUST00000180395 3220 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm37623-201ENSMUST00000193691 803 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Mef2c-219ENSMUST00000198217 1257 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Mef2c-225ENSMUST00000199210 1185 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 AC140406.2-201ENSMUST00000227539 481 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Sec16b-201ENSMUST00000027881 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm26003-201ENSMUST00000083061 113 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Olfr806-202ENSMUST00000213239 3724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm4907-201ENSMUST00000116614 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Kif5a-202ENSMUST00000217895 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 4921509C19Rik-201ENSMUST00000080132 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm36799-201ENSMUST00000214113 1737 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm43280-201ENSMUST00000202958 1550 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d24-208ENSMUST00000201089 4081 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Efcab9-202ENSMUST00000109377 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm8087-201ENSMUST00000119091 567 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm15742-201ENSMUST00000123905 659 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms