Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm26719-201ENSMUST00000180395 3220 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Olfr353-202ENSMUST00000215925 1615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Acvr1-202ENSMUST00000090935 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Mei1-203ENSMUST00000188048 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Speer9-ps1-201ENSMUST00000203447 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm27048-201ENSMUST00000182891 4627 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Ipcef1-201ENSMUST00000078070 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Slc13a2os-201ENSMUST00000149865 3627 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 B230354K17Rik-201ENSMUST00000181149 4897 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Ankrd45-202ENSMUST00000111608 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Olfr802-202ENSMUST00000203785 5535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Nkrf-201ENSMUST00000057093 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Etl4-206ENSMUST00000114608 6635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ttbk1Q6PCN3 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms