Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Nrk-201ENSMUST00000064937 6604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Myo6-202ENSMUST00000076140 7663 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Olfr6-201ENSMUST00000040983 6834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Zfp292-201ENSMUST00000047950 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc18Q640L5 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms