Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms