Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm9866-203ENSMUST00000182592 8487 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxc11P31313 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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