Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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