Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms