Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
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