Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Dusp3-202ENSMUST00000107172 4445 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CubnQ9JLB4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CubnQ9JLB4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CubnQ9JLB4 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CubnQ9JLB4 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CubnQ9JLB4 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Tbc1d24-207ENSMUST00000171189 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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CubnQ9JLB4 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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