Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 AC156025.3-201ENSMUST00000225919 3095 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NcanP55066 Unc45b-202ENSMUST00000108160 4152 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Vmn1r51-203ENSMUST00000226542 4164 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Slc43a2-211ENSMUST00000169547 7145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm37739-201ENSMUST00000191742 1505 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm38003-201ENSMUST00000191968 1504 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Adgrl2-214ENSMUST00000199238 4670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Nfasc-202ENSMUST00000094569 9739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NcanP55066 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm37150-201ENSMUST00000193900 2754 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Col25a1-202ENSMUST00000106353 6701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NcanP55066 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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