Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cux1P53564 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Sptbn1-203ENSMUST00000102838 9107 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Pak7-202ENSMUST00000077200 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Map3k7-203ENSMUST00000108183 5416 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Helz2-203ENSMUST00000121484 10063 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Klhl32-203ENSMUST00000108214 5970 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cux1P53564 4931406B18Rik-208ENSMUST00000191516 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Pcm1-201ENSMUST00000045218 6624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Saal1-201ENSMUST00000143082 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Olfr6-201ENSMUST00000040983 6834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Olfr775-202ENSMUST00000214109 3598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Olfr224-204ENSMUST00000217009 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cux1P53564 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms