Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gzmk-202ENSMUST00000122399 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm7364-201ENSMUST00000188760 1501 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC162467.2-201ENSMUST00000219397 2571 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm15028-201ENSMUST00000120295 370 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm13726-201ENSMUST00000121278 794 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Bnip1-206ENSMUST00000135824 629 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 F730035M05Rik-201ENSMUST00000145871 1296 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm26040-201ENSMUST00000158147 161 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Stard6-202ENSMUST00000164223 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm17188-202ENSMUST00000165178 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 4933406F09Rik-202ENSMUST00000180508 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm18301-201ENSMUST00000185261 888 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm28444-201ENSMUST00000190777 2137 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Rpl22l1-206ENSMUST00000194649 525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Mef2c-219ENSMUST00000198217 1257 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Mef2c-225ENSMUST00000199210 1185 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm43837-201ENSMUST00000200306 668 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 4933432K03Rik-201ENSMUST00000205739 1247 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC125543.2-201ENSMUST00000222114 105 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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VdrP48281 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Psors1c2-201ENSMUST00000025273 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gkn2-201ENSMUST00000032128 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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VdrP48281 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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VdrP48281 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
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VdrP48281 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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VdrP48281 Olfr5-201ENSMUST00000086318 1044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr659-201ENSMUST00000098170 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Hdhd2-209ENSMUST00000150990 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm26629-201ENSMUST00000180848 2276 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 4930443O20Rik-201ENSMUST00000135659 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Tm4sf20-201ENSMUST00000027331 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
VdrP48281 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
VdrP48281 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
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