Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RxraP28700 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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RxraP28700 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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RxraP28700 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RxraP28700 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
RxraP28700 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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