Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm18192-201ENSMUST00000210174 941 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Spaca7-203ENSMUST00000210276 715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm45283-201ENSMUST00000210593 628 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm30808-201ENSMUST00000211166 845 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm45712-201ENSMUST00000212417 335 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 9230104L09Rik-201ENSMUST00000028937 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Rpsa-ps2-201ENSMUST00000059546 880 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Spen-201ENSMUST00000078886 12082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Nkrf-201ENSMUST00000057093 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Il10ra-201ENSMUST00000034594 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr1198-202ENSMUST00000215179 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Satb1-203ENSMUST00000129667 2896 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm13081-201ENSMUST00000121527 5599 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Bdnf-202ENSMUST00000111042 3905 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm23946-201ENSMUST00000104423 197 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Samd13-201ENSMUST00000124931 905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Cldn20-201ENSMUST00000168560 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Mark1-ps3-201ENSMUST00000184922 694 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm34418-201ENSMUST00000212879 309 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 4930401C15Rik-201ENSMUST00000218300 865 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Slurp1-201ENSMUST00000023261 567 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm15401-201ENSMUST00000081929 1107 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm37334-201ENSMUST00000192325 2938 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Eif2ak4-204ENSMUST00000110870 5116 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Pofut1-206ENSMUST00000123487 4143 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ltn1-201ENSMUST00000039449 7737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Zfp426-210ENSMUST00000167457 4262 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm26629-201ENSMUST00000180848 2276 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm44850-201ENSMUST00000205621 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 AW209491-201ENSMUST00000038690 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Mapk9-203ENSMUST00000102778 4447 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Pum3-201ENSMUST00000076219 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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