Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rubie-201ENSMUST00000151828 1137 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm16031-201ENSMUST00000153253 448 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 1700029J03Rik-202ENSMUST00000189879 712 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm43461-201ENSMUST00000202351 996 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm45255-201ENSMUST00000209943 811 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr503-202ENSMUST00000211693 966 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr503-201ENSMUST00000078162 972 ntAPPRIS P2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr1286-201ENSMUST00000099617 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm12378-201ENSMUST00000116171 1461 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr650-ps1-201ENSMUST00000121432 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm15999-201ENSMUST00000127317 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm25762-201ENSMUST00000103984 132 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm11730-202ENSMUST00000147186 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm24899-201ENSMUST00000158892 73 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Snhg7-201ENSMUST00000181621 139 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 1700036G14Rik-201ENSMUST00000189046 542 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rabgef1Q9JM13 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
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