Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Klf12-205ENSMUST00000228216 5890 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Hdac4-202ENSMUST00000097644 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 AC165260.6-204ENSMUST00000225571 3508 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Col5a3Q9JLI2 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Myom1-203ENSMUST00000179759 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Myom1-201ENSMUST00000024847 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Arhgef9-207ENSMUST00000113885 4578 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Col5a3Q9JLI2 Smcr8-201ENSMUST00000056907 7391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Dusp3-203ENSMUST00000107173 4311 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Col5a3Q9JLI2 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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Col5a3Q9JLI2 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Tas1r3-201ENSMUST00000030949 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Pcdhb11-201ENSMUST00000053073 4419 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms