Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Sptan1-203ENSMUST00000100225 7892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Sptan1-202ENSMUST00000095083 7883 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 4932431P20Rik-202ENSMUST00000141713 9288 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ccdc18Q640L5 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ccdc18Q640L5 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ccdc18Q640L5 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ccdc18Q640L5 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ccdc18Q640L5 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Slc43a2-211ENSMUST00000169547 7145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Ano4-210ENSMUST00000182790 4018 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ccdc18Q640L5 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc18Q640L5 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms