Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Tgfb3-201ENSMUST00000003687 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Arpp21-203ENSMUST00000111872 3316 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Arpp21-229ENSMUST00000164754 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Dlgap5-201ENSMUST00000043296 2964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm36993-201ENSMUST00000192983 2980 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Ikbke-201ENSMUST00000062108 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Tab3-201ENSMUST00000048250 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hoxd10P28359 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms