Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Patj-202ENSMUST00000041284 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Rabl3-201ENSMUST00000023524 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Cacna2d4-205ENSMUST00000186622 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm26629-201ENSMUST00000180848 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 AC164437.4-202ENSMUST00000228794 2413 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Vmn1r40-204ENSMUST00000228485 2689 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Rdh9-201ENSMUST00000052652 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Ccdc36-201ENSMUST00000076592 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Msh4-205ENSMUST00000190449 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm17979-201ENSMUST00000196646 611 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gpx4-ps2-202ENSMUST00000217344 782 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 AC126805.1-201ENSMUST00000225142 262 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Spats1-201ENSMUST00000024731 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Man2b1-201ENSMUST00000034121 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Slc36a3-202ENSMUST00000069816 893 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Olfr2-201ENSMUST00000094109 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Zfp809-205ENSMUST00000215618 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prim1P20664 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Stx8-203ENSMUST00000108675 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm40309-201ENSMUST00000202699 1752 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Zfp607b-201ENSMUST00000076421 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Mill2-205ENSMUST00000227379 1998 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Aldoart1-201ENSMUST00000078617 2052 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Parp9-202ENSMUST00000114877 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Unc45b-201ENSMUST00000018989 3549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Nufip1-201ENSMUST00000022586 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm43336-201ENSMUST00000200487 4504 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Xntrpc-202ENSMUST00000094129 4150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Zfp40-201ENSMUST00000037057 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 C5ar2-202ENSMUST00000171425 3381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Rpgr-203ENSMUST00000073392 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Wdr76-202ENSMUST00000099473 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Olfr1214-202ENSMUST00000216026 2126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Khdc1a-201ENSMUST00000088407 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Spef2-205ENSMUST00000162780 1639 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Coro7-201ENSMUST00000038552 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Stat1-206ENSMUST00000186857 4241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm23946-201ENSMUST00000104423 197 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm12354-201ENSMUST00000124319 554 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm24083-201ENSMUST00000175174 120 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prim1P20664 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms