Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm7831-201ENSMUST00000117990 552 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccl20O89093 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms