Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm37040-201ENSMUST00000191740 1824 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Vmn1r16-202ENSMUST00000227283 5813 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usf3B2RUQ2 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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