Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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Prpf39Q8K2Z2 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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