Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Trim17Q7TPM3 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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