Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Tcf23-201ENSMUST00000006818 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm27435-201ENSMUST00000183588 88 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
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Rpusd2Q149F1 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm33882-201ENSMUST00000208990 651 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 5330417C22Rik-201ENSMUST00000048012 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Ikbke-201ENSMUST00000062108 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm26748-201ENSMUST00000180406 2972 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Hmgcs1-202ENSMUST00000224188 3464 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Aldoart1-202ENSMUST00000179234 2050 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Rbms2-202ENSMUST00000099139 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Crtam-201ENSMUST00000034519 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Trpa1-201ENSMUST00000041447 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Acly-207ENSMUST00000165111 4162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 D7Ertd443e-201ENSMUST00000094002 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 AC120163.1-201ENSMUST00000228618 1680 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Zfp800-201ENSMUST00000035930 3881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
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Rpusd2Q149F1 Tnfaip1-202ENSMUST00000108277 3768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Trim21-202ENSMUST00000106913 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
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Rpusd2Q149F1 Nckap1l-201ENSMUST00000047405 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Smpd4-203ENSMUST00000090159 4565 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Trmt13-201ENSMUST00000041524 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Olfr1426-206ENSMUST00000219996 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Synj1-210ENSMUST00000170853 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Slc12a3-201ENSMUST00000034218 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm11870-201ENSMUST00000119255 1322 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Synj2-209ENSMUST00000115790 4808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpusd2Q149F1 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
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