Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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VgfQ0VGU4 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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VgfQ0VGU4 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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VgfQ0VGU4 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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VgfQ0VGU4 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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VgfQ0VGU4 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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VgfQ0VGU4 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
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VgfQ0VGU4 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
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VgfQ0VGU4 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
VgfQ0VGU4 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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