Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms