Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NcanP55066 Rorb-203ENSMUST00000112832 9293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Map3k7-204ENSMUST00000108184 5491 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Slc38a9-201ENSMUST00000052514 8910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Mtif2-201ENSMUST00000020749 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Ankrd6-201ENSMUST00000035719 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NcanP55066 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Dab1-201ENSMUST00000106826 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NcanP55066 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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