Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
H2-Eb1P04230 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
H2-Eb1P04230 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms