Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 B430010I23Rik-201ENSMUST00000123703 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm28469-201ENSMUST00000186374 2166 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm28945-201ENSMUST00000187780 2165 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm28134-201ENSMUST00000188690 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm29622-201ENSMUST00000190914 2165 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm37075-201ENSMUST00000191888 2166 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm37574-201ENSMUST00000194264 2166 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Trerf1-205ENSMUST00000190080 7045 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm26903-201ENSMUST00000180749 4583 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Bco2-201ENSMUST00000119103 2118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Pkd2l2-202ENSMUST00000166156 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm31182-201ENSMUST00000219061 2391 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Asb14-203ENSMUST00000165929 1817 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Slco4c1-201ENSMUST00000071985 4908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Usp4-209ENSMUST00000194959 3436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Fgfbp1-202ENSMUST00000199481 2191 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Eif4e2-201ENSMUST00000050876 2869 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Tmem63c-203ENSMUST00000146292 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Arhgap6-205ENSMUST00000112131 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Rplp1-ps1-201ENSMUST00000119410 345 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm12035-201ENSMUST00000121890 623 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm12221-201ENSMUST00000125096 1131 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Rnf141-210ENSMUST00000177462 859 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 E330020D12Rik-203ENSMUST00000188717 766 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm8991-201ENSMUST00000073014 1075 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm10132-201ENSMUST00000099431 468 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Best3-201ENSMUST00000020378 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Slc7a9-202ENSMUST00000118383 1869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Ces1e-203ENSMUST00000176282 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Dis3l2-201ENSMUST00000065694 3085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Vwa3b-203ENSMUST00000117172 1636 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Riok3Q9DBU3 Snrpd3-201ENSMUST00000020397 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.8 ms