Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc18Q640L5 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Retreg1-203ENSMUST00000226438 2783 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ccdc18Q640L5 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Thada-201ENSMUST00000047524 7884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ccdc18Q640L5 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ccdc18Q640L5 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Nemp1-201ENSMUST00000048099 6002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ccdc18Q640L5 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ccdc18Q640L5 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ccdc18Q640L5 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Pum1-205ENSMUST00000105992 5058 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Oasl2-201ENSMUST00000031542 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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