Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Adgrl3-212ENSMUST00000120144 4999 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms